Tras ganar el Campeonato de España de Karting en 1990, Marc Gené siguió un año más compitiendo en los karts antes de pasar a la Fórmula Ford española en el año 1992. Tras sumar varias victorias en esta categoría las dos siguientes temporadas, el piloto catalán participó en el Campeonato Británico de F3 en 1994. A continuación pasó a la F3000 en 1997, pero su primer gran éxito llegaría al adjudicarse el titulo del Open Fortuna by Nissan en 1998. 

Este éxito le catapultó hasta la Fórmula Uno, donde debutó en 1999 como piloto del equipo Minardi, escudería con la que completó 33 Grandes Premios durante dos años. Tras quedarse sin volante en 2001, Gené aceptó el puesto de probador en el equipo BMW Williams. Marc participó en tres Grandes Premios en sustitución de Ralf Schumacher, y mientras que en Monza 2003 demostró un pilotaje muy maduro concluyendo en quinta posición, en los Grandes Premios de Francia y Gran Bretaña 2004 no tuvo tanta suerte. 

En el 2005 aceptó una propuesta de Ferrari para pasar a ser uno de sus pilotos de pruebas y sigue en la Scuderia alternando las labores de probador con su participación en las Le Mans Series con Peugeot.